2008-06-09 (月)
*[プログラミング] EndoさんのRNAポリメラーゼ
最近，なるべくポインタを使わないようにしてたけど，もう無理かも．今のところは，ソース中に「&」や乗算とイテレータ以外の「*」という文字は出てきません．…と書いたけど，引数の参照渡しは使ってた．
gprofしたら，たぶんstringが内部で呼んでるであろうmemcpyが90%の時間を使ってた．
protect()のためにDNAをコピーしまくるのが原因か．protectのうち９割以上は一回も書き換えを行わないので，参照カウントで実装すればまともに動きそうだなぁ．あまりやる気が出ないけど．